Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul3Q9JLV5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cul3Q9JLV5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms