Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Higd1aQ9JLR9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Higd1aQ9JLR9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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