Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh9a1Q9JLJ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms