Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms