Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm1Q9JLF6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tgm1Q9JLF6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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