Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnot9Q9JKY0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnot9Q9JKY0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms