Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk3aQ9JKX8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms