Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx5Q9JKQ4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx5Q9JKQ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx5Q9JKQ4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms