Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf3Q9JKL4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf3Q9JKL4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf3Q9JKL4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms