Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx6Q9JKK1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx6Q9JKK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx6Q9JKK1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms