Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nectin1Q9JKF6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin1Q9JKF6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin1Q9JKF6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms