Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trem1Q9JKE2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trem1Q9JKE2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trem1Q9JKE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms