Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scamp5Q9JKD3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scamp5Q9JKD3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms