Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl3Q9JKB1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl3Q9JKB1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms