Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd3Q9JJY3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd3Q9JJY3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms