Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms