Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem47Q9JJG6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem47Q9JJG6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem47Q9JJG6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms