Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp29Q9ES63 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp29Q9ES63 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms