Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim54Q9ERP3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim54Q9ERP3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms