Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cse1lQ9ERK4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cse1lQ9ERK4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cse1lQ9ERK4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms