Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr61Q9ERF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr61Q9ERF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms