Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snap29Q9ERB0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snap29Q9ERB0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms