Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf23Q9ER63 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf23Q9ER63 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms