Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra8Q9EQ48 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1ra8Q9EQ48 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms