Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcr6Q9EQ16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms