Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp1bQ9EPL6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms