Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Aph1cQ9DCZ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms