Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ftsj3Q9DBE9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms