Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA9

Gtf2h1, General transcription factor IIH subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h1Q9DBA9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h1Q9DBA9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2h1Q9DBA9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h1Q9DBA9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms