Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd8Q9DA37 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd8Q9DA37 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms