Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldnd2Q9D9H2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldnd2Q9D9H2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd2Q9D9H2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd2Q9D9H2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms