Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmco5aQ9D9D5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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