Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg7Q9D906 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg7Q9D906 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg7Q9D906 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms