Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332 ms