Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D8N1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8N1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8N1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D8N1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8N1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms