Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp5Q9D7S9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp5Q9D7S9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp5Q9D7S9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms