Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem54Q9D7S1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem54Q9D7S1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem54Q9D7S1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms