Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9bQ9D6E4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc9bQ9D6E4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms