Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr42e1Q9D665 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr42e1Q9D665 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr42e1Q9D665 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms