Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip1Q9D620 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip1Q9D620 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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