Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zc2hc1bQ9D534 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc2hc1bQ9D534 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms