Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhox2aQ9D4Y3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox2aQ9D4Y3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox2aQ9D4Y3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox2aQ9D4Y3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox2aQ9D4Y3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms