Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efhd1Q9D4J1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Efhd1Q9D4J1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efhd1Q9D4J1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms