Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul2Q9D4H8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul2Q9D4H8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul2Q9D4H8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms