Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcc1Q9D4H2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gcc1Q9D4H2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms