Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc6Q9D4E6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc6Q9D4E6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc6Q9D4E6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms