Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpn3Q9D3W4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpn3Q9D3W4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpn3Q9D3W4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpn3Q9D3W4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpn3Q9D3W4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpn3Q9D3W4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms