Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rasgef1cQ9D300 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms