Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms