Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Erp44Q9D1Q6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Erp44Q9D1Q6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erp44Q9D1Q6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms